Medan Scully förbereder sig inför sitt barns födelse, förbereder sig också fler och fler personer i hemlighet. Sköterskan som Scullys mamma anställt, Alex Krycek och många andra oroar sig över Scullys ofödda barns säkerhet. Eftersom Krycek tror att barnet är ett hot mot utomjordingarna erbjuder han sin hjälp, men hans slutgiltiga konfrontation med Mulder och Skinner slutar i våld. Under tiden flyr Scully och Agent Reyes till en okänd plats, men möts där av utomjordingar som hävdar att Scully's barn tillhör dem...